ソラとモモの活躍により平和を取り戻したドルフィンアイランド。ゲームの世界から現実に戻ったソラに事件が起こります。平和なドルフィンアイランドのプログラムが何者かによって書き換えられ、苦労して倒したはずの魔王が復活。ゲーム・カセットを持っていた、クラスメイト達は全て魔王に捕らえられます。現実の世界でプログラマーを探すソラ。ソラの代わりにゲームの世界に乗り込み、クラスメイト奪還に向かうアイシャ。２つの世界を行き来しながら魔王を倒し、クラスメイトを救い出すことはできるのか。